败回大营之后，阿巴泰计点清军的损失，这一战清军出动了二万五千多人马参战，出战的人数多达近二万余人，阵亡的人数竟高达六千余众，其中包括满八千的披甲兵一千六百余人，辅兵二千五百佘人。有六个牛录基本全军覆没，如果再加上第一天损失的人马，清军战死的人数以经达到了全军的三成以上，虽然不算是元气大伤，但也是损失惨重了。大清自建国之后历年以来，五次攻明之战，还没有那一次败得这么惨的。
而在当天晚上，阿巴泰就病倒在大营里。原来阿巴泰毕竟也是年过五十的人，在第一次攻城战中淋了一天的雨，寒气就以经侵入体内，今天一战在战场上还吐了血，虽然当时还强自撑着，但回营之后，阿巴泰又羞又气，心里着急加上火，因此就两眼一黑，就昏倒在地不醒人事了。
图尔格和其他的众甲喇、牛录见了也都大吃一惊，赶忙找军医来给阿巴泰看病，其实在这个时代，无论是清军还是明朝，军队里的医疗水平都很低，军医只能看一些简单的刀剑伤，基本都是聊胜于无。被找来的两个军医费了好半天的劲，揉前胸、捶后背、掐人中，好不容易才算是把阿巴泰给弄醒了过来。然后又给开了几付药，这才退了下去。
虽然知道阿巴泰病重，需要休养，但现在可不是平安的时候，大军也不可能就这么扎在济南城下。因此图尔格只好坐在病床前和阿巴泰商议，济南城恐怕是打不下来了，还是尽早撤军北返算了。
阿巴泰虽然人昏昏沉沉的，但脑子却还很明白，虽然现在清军剩余的兵力还有两万三四千人，但最精锐的满八旗披甲兵却拆损大半，而且全军的士气低落，在这个时候，别说继续攻打济南，就是想全身而退，返回关外都不是一件容易的事情。就算明军中不出第二个商毅，只要是再有一二个卢象升这样敢打的人，在中途再拦截清军一下，只怕也够清军受了。因此还不如尽早撤军，赶上博洛的前队人马，合兵之后一起撤退。同时，阿巴泰也因为自己有病，不能理事，将全军的指挥大权交给了图尔格。
两人商量确定之后，图尔格立刻下令，放弃营中的所有辎重，全军只带十天的口粮，连夜就撤军。而随军充当苦役的三千多名明朝的百姓全部杀死，连同留下来的辎重粮草物资一把火烧光。同时又命人去通知驻守东昌府的岳乐，让他将东昌府全城屠尽，放火烧光，然后与自己的人马汇合，一起北返。
到了第二天一早，等商毅接到了消息之后，来到济南城西南的清军营地时，这里己经只剩下一片瓦砾废墟，其中还有三千多俱烧得焦黑的尸体。不用猜也能知道，这些尸体一定都是被俘的明朝百姓了。
到了这时，商毅也终于能够确定，清军以经完全从济南府境內撤走了，比在另一个时空里, 差不多提前了一个月。根据史料记载，这次清军入关奔袭，一共掠走了明朝的人口三十六万九千余人，虽然商毅解救了十五万左右的百姓，但还是有超过二十万的人口被淸军掠到关外。
不过商毅对此也无能为力了，他以经尽了自己的全力，在这次清军的入关奔袭中，能够保护一方的百姓，能够守住穆陵关，能够从清军的虎口中夺下济南，解救出十几万人口，这以经就是一个奇迹了，商毅当然知道,自己不可能做得更多了。
感概了一番之后，商毅命人清理百姓的残骸，找地方掩埋。同时又开始打扫昨天激战之后的战场。
这一次守卫济南，一共顶住了淸军两次攻城，共计斩首六千七百三十五级，生擒二百五十七人，如果不是有许多尸体被炸烂，还有一部份尸体被掩埋在地下，斩首的数量将会超过七千。而缴获的战利品有火炮八门、铁甲二千八百二十七件、锁甲一千五百七十七件、棉甲三千一百五十九件、皮甲二千二百八十二件，刀枪盾牌锣鼓旗帜等器械计有七千四百八十三件，同时还夺得了战马一百一十七匹，并且又从淸军们身上搜出了白银七万佘两。胜利也算是十分辉煌了。
而穆陵军自身也战死了一千零七十三人，大部都是在济南府招募的新军，这也就是老兵和新兵的差别。但经过了这一战的磨砺之后，相信这些新兵也会加快成熟的时间。
虽然商毅估计这一回清军是真的撤走了，但还是不敢大意，仍然派出侦察兵向去打听清军的动向，一直到三天以后，清军以经完全走出了山东境内，连东昌府的清军也撤了，虽然在清军撤走时，进行了一次屠城，并且又放了一把火，将东昌府烧了个干干净净，但毕竟东昌府不是在商毅的防区內，他也才算完全放下心来。自己穿越到这个时代之后，大半年的努力，就是为了对付这一次清军进攻，现在这一关终于抗是过去了。
这时沈扬也来向商毅告辞，表示清军撤退之后，锦衣卫在山东也没有事了，因此也要北上到河北山西一带去打探清军的动态。同时沈扬还吿诉商毅，穆陵军取得的战功他以经如实的全部报到了北京的朝廷，相信用不了多久，朝廷就会下旨到青州府来，对商毅加官进爵，而按惯列，商毅会到北京去亲自面见皇帝谢恩，并在兵部和五军都督府扮理相关的手续，也许在不久之后，他们会在北京重逢。
虽然这段时间以来，商毅对这伙锦衣卫的印像还不错，这次能够顺利的攻下济南府，他们也帮了自己不少忙，但毕竟锦衣卫的名声再外，对这帮人还是敬而远之才好。因此听说他们要走，也是求之不得，立刻安排下酒宴，为他们践行，当然对每人也送上了价值不菲的厚礼。
第二天一早，商毅又带着穆陵军的众将把锦衣卫的一行人送出济南城，然后和众人一一告别。只有送到周威的时候，这个还作男装打扮的小姑娘看着商毅久久不语，最后才轻轻说了一句：“商毅，你自己保重。我可等着在北京见你。”
商毅也呵呵一笑，低声道：“好啊！不过下次见面的时候你可要换上女装。”
周威顿时满面通红，一转身，逃跑似得走了。只有沈扬、刘知用、赵从夫三个人远远看着，互相摇头苦笑。
其实商毅也不是反应迟顿的人,当然感觉的出来，在这段时间里，周威以经明显对自己产生了好感，这也不奇怪，因为在这段时间以来，自己也表现出了出色的军事才能，而且多次打败清军，对于她这个年纪的小姑娘来说，自然是非觉有吸引力的。
不过直到现在为止，商毅还不清楚，周威到底是什么身份，顶着一个镇抚的头衔，无论是不是真的，都说明她和锦衣卫的关系十分密切，按商毅推断，她有可能是出自锦衣卫世家，父亲、祖父都是在锦衣卫中任职。这到是并不奇怪，因为锦衣卫是可以世袭的。
但自己和这个小姑娘能不能继续发展下去，现在还不好说。不过这个小姑娘的美貌对商毅还是很有吸引力的。毕竟自己拒绝了玄皇教，平白放跑了一个大美女，是不是也该在其他方面弥补一下。而且对这些身份的事情，商毅到并不太在意，虽然他对锦衣卫没有多少好感，但也谈不上恶感。而锦衣卫是依附于皇权存在的，大明朝都只剩下不到一年的寿命了，等大明朝一完，锦衣卫自然也就跟着完了。虽然说自己以经娶了叶瑶瑱，不过只耍是正常的男人，谁会嫌美女少呢？反正一切就顺其自然了。
商毅一边胡思乱想着，锦衣卫一行也都以经走远了。商毅这才回过头来，忽然发现周少桓、吴汉生、童大勇、成进、杨武丞、罗远斌等人都用一种异样的目光看着自己。商毅也不禁有些奇怪，他们这是怎么了，莫非是在嫉妒自己得到了美女的青睐。
商毅心里不禁一阵暗爽，都羡慕吧，谁让我是穿越来的呢？这可是穿越人士的铁定定律之一。因此也咳嗽了一声，现要装出一付满不在乎的样子，招呼众人回城去，这时周少桓上前一步，道：“大人，我们一直都沒有看出来，原来大人有这种癖好。” 其他人的脸上也都露出了“原来是这样”“以前还真没看出来” 的表情。
商毅怔了一怔，癖好？自己有什么廦好？忽然想了起来，除了自己和锦衣卫的人之外，其他人可不知道周威其实是女儿身，只不过以为她是一个长得很标致的美少年而已。这么一来，自己刚才和周威那一番密语不就成了…….
想到这里，商毅身上也不禁出了一身爆汗，这个误会可大了，急忙摆了摆手，道：“不是这样，你们都弄错了, 这是……”