双龙市的双龙道馆最近又重新开张了，斗子和鸣依想要去取得她们的最后一枚徽章。
而小智则只是单纯地想去拿下第十枚徽章，向合众地区最强的道馆训练家夏卡讨教讨教。
路过一座宝可梦幼儿园之后，小智一行人再次回到了竹兰在涟漪镇的别墅里。
因为要从青海波市去到双龙市，从涟漪镇拐过去会比较近。
再次回到了熟悉的地方，美洛耶塔也安心地唱起了古老之歌。
与此同时，在涟漪镇附近海域的一座海上基地那里，一架印有一个巨大的红色“R”字标记的豪华私人客机缓缓地降落在基地的停机坪上。
塞格博士正带着几百名火箭队队员在此整齐列队，恭迎坂木的到来。
“坂木老大，塞格率基地全体成员恭迎您的到来。”
“嗯，从今天开始，合众地区将纳入我们火箭队的管辖，
暴风雨计划，正式进入最后阶段！”
坂木望着远处的大海，充满野心地说道。
“遵命。”
隔天一早，涟漪镇。
一只泥偶巨人从空中飞行而来，降落在别墅的院子里。
一个男人从泥偶巨人身上跳了下来，叮嘱道，
“泥偶巨人，捕捉到旋律了，空气在颤动，这种感觉一定是美洛耶塔不会错。”
听到有人到别墅里来，小智起身去看看，发现有个不认识的男人正在别墅的院子里，似乎在找什么东西，还带了一只泥偶巨人来。
而美洛耶塔一见到那个男人，便激动地飞过去，扑进他的怀里。
“美洛！”
“美洛耶塔，你没事真是太好了。”那男人也惊喜道。
小智随即把他迎进客厅里。
那人把泥偶巨人留在院子里负责警戒之后便跟小智进屋。
“真是非常感谢你们帮我保护美洛耶塔，
我叫拉里，正在跟我的泥偶巨人一起寻找美洛耶塔，
你叫做小智是吧，美洛耶塔它现在好像已经跟你很亲近了呢。”
“是啊，对了，拉里先生，到底发生什么事了？为什么美洛耶塔会跟你分开，被火箭队的人追捕呢？”
“哦，是这样的，我们和美洛耶塔，本来是一起隐居在合众地区的某座森林的深处，
可是某一天，我们隐居的地方被人发现了，在我没有注意到的时候，美洛耶塔就被那些坏人们给抓走了，
那群坏人，一定是在觊觎美洛耶塔所拥有的力量，这件事是我的重大失误，所以我才会一直到处寻找美洛耶塔的踪影。”
据拉里所说，当时靠着火箭队的人宝可梦的招式黑雾的掩护，抓走了美洛耶塔。
用的笼子小智猜测也是之前火箭队用来抓三云神的那同款抓捕神兽专用笼子，因为拉里说他的宝可梦的技能根本无法破坏那个笼子。
拉里对此很是自责，因为美洛耶塔出事的时候，他刚好有事离开了，没有在美洛耶塔的身边。
等到他收到消息赶过去的时候，美洛耶塔已经被火箭队的人关进笼子里运上直升机了。
拉里拼命想要把美洛耶塔救出来，但是根本无法破坏那个笼子，靠着黑雾的掩护，火箭队的直升机很快便扬长而去。
“可恶的火箭队，我是不会让他们得逞的。”小智道。
“没想到竟然有这种事，火箭队他们抓捕美洛耶塔，到底有什么目的？”斗子问道。
“火箭队他们的目的并不是美洛耶塔，而是回应神殿散发出的光芒而出现的传说中的宝可梦们，
拥有美洛耶塔的人，就可以掌控巨大的力量，从遥远的太古时代开始，人们就为了得到那股力量，而不断地争战抢夺美洛耶塔，那力量指的就是沉睡在神殿中的现形镜，
美洛耶塔，是这个世界上唯一能够解开现形镜封印的宝可梦，通过现形镜，可以掌控操纵大自然的力量，
能做到这件事的，只有世世代代和美洛耶塔一同生活的守护者们的领袖而已，
可是，为了得到那股力量，那些邪恶的人们不断地争夺并掀起战火，
美洛耶塔发现自己的存在会引起征战，就把神殿沉入水底，然后和我们守护者们的祖先一起，将自己的行踪隐藏起来，
如果有人想要得到现形镜的话，就必须要有美洛耶塔的歌声。”拉里道。
“那美洛耶塔是拉里先生你的宝可梦吗？”鸣依问道。
“不，美洛耶塔并不属于任何人，它是以合众地区的幻之宝可梦的身份存留在人们的传说当中的，
我们则是自古以来就被称为守护者，就是指守护美洛耶塔的人，
我们守护者拥有感知美洛耶塔的力量的能力，所以我才能找到这个地方来，
只是现在还不能放心，那些坏人，应该也还在寻找美洛耶塔。”拉里道。
“那要是敌人现在已经来了呢。”小智淡淡道。
“你说什么！”
拉里的话音刚落，小智便没有说话，直接抬手凝聚出一发波导弹。
击碎了客厅沙发后面的一面窗户玻璃的同时，还击毁了一架飞着的微型无人摄像机。
“啊，那是！果然来了，这里也被他们发现了，美洛耶塔，我们快走，不能再拖拖拉拉的了。”
说完，拉里急切地抱起美洛耶塔就要离开。
“等等，你们现在又能去哪里，你们之前隐居的地方已经被火箭队的人发现了，
而我猜测此刻，这座别墅大概率也已经被火箭队的人给包围住了。”小智道。
“隐居的地方倒是无所谓，我的同伴们已经在找新的地方了，可是你说他们已经包围了这里！”
“没错，我有波导之力。”
“火箭队的人也太大胆了吧，这里可是神奥地区的地区冠军竹兰小姐的别墅啊，难道他们不怕吗？”鸣依道。
“冠军！”
听到这话，拉里的眼睛亮了，仿佛找到了救命稻草。
“可是竹兰小姐几天前就出去了，去出席活动去了，到现在还没有回来啊。”斗子道。
闻言，拉里顿时如同被浇了一桶冷水一样，希望全灭。