三人讨论了很长时间，不断的完善各项方案，尽量避免一些不必要的麻烦，他们也都被黄煜说服了，准备先回去准备，等黄煜下令，就可以开始实施全面的改革。
黄煜三人在京城准备改革的时候，倭国，明军的三路大军全部集结在了江户，把最后还在抵抗的德川家及其余反抗势力全部围困在了江户；章天雷召集王祥雨、周杨波、冯宝之、颜思齐、郑芝龙、杨天生、闫志航、章三虎、关守文、孟仕安、石强、石磊、高福以及投诚的松浦隆信、前田利常等人，这也是倭国将领汇聚最齐的一次；
上次攻破京都后，有了后水尾天皇的投降旨意，再加上明军的兵峰之胜，很多小的藩主和将军都投降了，剩下比较顽固的都汇聚在了江户，现在刚好被彻底围困；
章天雷看着眼前一众轻松说笑的将领们，他也是从心里高兴，倭国之战终于要结束了，这可是灭国之战，一场完全有他指挥的灭国之战，这一切都是黄煜给他的机会，他不能辜负黄煜的这份信任，一定要漂亮的完成这个任务。
章天雷轻轻的敲了敲桌子，看众人都停了下来，看向他然后说
“好了，都不要兴奋了；现在就剩这最后一战了，你们要是完成不了任务，我可是要重罚的”
“将军放心吧，我们一定漂亮的弯沉任务，您就下令吧”
“好，我命令：原东路军汇同前田家兵共同负责江户东部，北路军负责江户北部，西路军汇同松浦家兵负责西路，然后王祥雨、周杨波、冯宝之、颜思齐、郑芝龙你们海军负责江户南部，此战不要放走一个人，尤其海军决不能让他们逃进大海，否则会平添不少麻烦；侯爷还在京城等着我们的好消息呢，想要封赏就把此战打漂亮了”
一众将领立即立正敬礼大声喊道
“保证完成任务”
然后众将散去，各自去准备明天的决战；章天雷看着眼前的江户，使劲握了一下拳，然后平复了一下心情，回去休息等待明天的大战。
相对于明军的轻松氛围和旺盛的士气，江户城里的倭国将领和藩主都是垂头丧气的，他们这些天节节败退，现在更是被包围在了江户；
德川家光看着眼前的藩主、将领们说
“不要一副丧气的样子，现在我们已经没有其他的选择，只剩下誓死抵抗这一条路可走了，之前你们投降还来得及，现在就算是想要投降明军也不会接纳，就算接纳了你们，恐怕也不会有什么好的待遇；我们大和民族不能就这么败了，要发扬我们的武士道精神，就算是同归于尽也要拉着他们大明的士兵一起。”
德川家光的一番话确实唤起了他们的一丝斗志，但是他们的结局早已注定了，他们再怎么样也只能是负隅顽抗罢了。
第二天一早，各军准备妥当，随着章天雷的一声令下，四面同时发动了总攻，先是火炮齐射，江户的城防在众多的火炮之下，就像纸糊的一样很快就被轰开了多出缺口，但是炮击并没有立即停止，依然在进行着炮击，足足进行了20轮炮击，江户的城墙已经被撕开了很多的大口子；步兵们才开始配合火炮发动总攻。
总攻很是顺利各军都攻入了城中，但是很快就有士兵向章天雷禀报
“将军，我们开始的攻击很顺利，但是入城之后，城内的倭国士兵明知道必死，抵抗的非常坚决，甚至有些人假意投降，然后偷袭明军，城里的倭国百姓也都受德川家的蛊惑，也在偷袭我们的士兵，我军的伤亡在增加；前线将领请将军指示”
章天雷听了士兵的禀告很是愤怒，真是应了侯爷说的，非我族类，其心必异，对付外族时不能保留善心，然后向传令兵道
“传令，既然倭奴不愿投降，那么我们就成全他们，屠城”
传令兵领命后，迅速前去个军传令去了，不久后江户城中开始传来哭喊声，很多的人都被杀怕了，想要投降了，但是有了前车之鉴，又有章天雷的军令，士兵们可是没有什么手软的，战局再次恢复一边倒；
通讯兵来到大营向章天雷报告：
“报告将军，经过两个小时的战斗，江户已经基本被控制，唯一剩下的抵抗势力都被包围在了德川家府邸之中；前线指挥让派我来请示将军的命令”
章天雷听了后立即整理了一下铠甲，说
“走，我们一起去看看，也该结束了”
之后章天雷率领人马来到德川家的府邸，简单的听取了一些报告，知道最后的顽固分子都藏在府内；章天雷说
“劝降了吗？如果劝过了，没有人投降就不用等了，把炮兵调过来轰开他，所有人员格杀勿论”
闫志航立即回答道
“已经劝过了，但是一直没有投降；我这就安排人员进攻”
其他的将领也都领命开始下去安排攻击人马，章天雷等人也没有离开就在德川家府邸外不远处看着；很快调派的火炮就被带了过来，他们调试好后直接开始攻击，等火炮轰开大门和府墙后，士兵们开始进入，进行最后的清剿；大约半个小时后，通讯兵来报已经完成了清剿，具松浦家和前田家的人指认，德川家的主要成员都已经伏诛，其他藩主等也都已经被杀，至此江户之战全部结束。
晚上章天雷在江户大营召开了战后会议，总结此战的战果，共计歼敌8万余，心怀不轨的百姓15万余，剩余15万余人全部居于外城，也全部无条件投降了；海军方面也击沉了逃跑船只80余艘，人员1万余人，基本没有什么人从江户逃出去。
当天章天雷命令举行了盛大的庆功活动，给士兵们提供了丰富的食物，但是没有允许喝酒，就这样士兵们也都非常的高兴，倭国的战争基本结束了，他们马上就可以回国了，侯爷的赏赐很快也会下来的。
章天雷简单的参加了庆祝活动就回去给黄煜写战报了，他要把整个倭国之战的进展情况全部写了一遍，抓紧送进京城，倭国接下来采取什么政策还要等黄煜的命令。
四天后，黄煜在京城收到了章天雷的送来的战报，知道了倭国已经全部平定，而此战己方的伤亡还是比较小的，一共伤亡战士5000余人，其中多是一些轻伤的，真正阵亡的只有2000人左右。
黄煜高兴的连忙找来了徐光启、徐骥把这个好消息告诉了他们，徐光启和徐骥也都是非常的高兴，明朝久受倭寇袭扰，现在终于好了，直接把倭国给拿下了，以后沿海再也没有倭患了。
黄煜高兴的说
“岳父、大哥，现在我们的形式可谓是一片大好，三面作战已经全面胜利了，我们要尽快制定犒赏和抚恤方案，另外我准备举行一次全国的大庆，此次大庆就定在三个月后，要让所有参战部队派出代表，其余省军队也要派出代表，每个地方1000人，我要在京城举行盛大的阅兵式，”
“抚恤还是按照我们南方军的标准进行吗？这样朝廷的银子恐怕不够啊”
徐骥立即提出了他的担心，这次三方大战，一共出动了四十余万军队，虽然一些军队的功劳少，犒赏的银子会少一些，但是架不住人多啊，则需要很大一笔银子。
徐骥的担心在黄煜看来还是很好解决的，
“大哥放心吧，这次我们打了胜仗，除了辽东战场我们没有多大的缴获外，其余两个方面都会有大量的缴获，这些银子足够补充我们此次大战的消耗和士兵们的犒赏、抚恤”
虽然一共缴获多少黄煜还不知道，但是他相信肯定不会少，明朝的这些个藩王，那个不是福的流油，东林党也大多都是当地的名门望族，家里也都比较富裕；更何况倭国了，那是一个国家，除了一些投降的藩主可以保留他们的一部分财富外，其余的全部都算缴获。
商量好了犒赏和抚恤的事，黄煜再次提到
“岳父、大哥，现在还有一件要事，倭国现在已经被我们占领了，接下来我们该怎么办？他们的天皇是投降的，我们要怎么对待他？这些都需要尽快处理”
对于这方面，徐骥是比较有发言权的，之前的安南就是他治理的，虽然没有倭国的局势复杂但是也有共同之处。于是徐骥思考了一下说
“倭国的情况比安南要复杂一些，但是总体来说还是有很多共同之处的，我看安南的政策很多都可以在倭国施行；就像要求他们官方语言改成汉话，文字也要该，慢慢的销毁他们的书籍，这个是长期的政策；短期的我们可以封他们的天皇为扶桑王，以后的扶桑王也都需要我大明敕封；另外就是禁止他们私人家族拥有武装，所有军队归于我们驻军管理统领，官员最好也都是我们派遣过去”